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紧密跟随国家产业指导及技术发展
科学家开发一种通过小规模测序检测癌症DNA的新方法浏览数:140  发布时间:2022-04-29 16:43

癌症患者的肿瘤细胞会释放部分DNA片段到血液中,,,这些来自肿瘤组织的DNA片段会携带突变。。。。在临床样本中发现罕见的DNA突变,,,对于生物医学和诊断学等领域均有重要的意义。。但精确地检测低丰度DNA难度大,,特别是在寻找癌症治疗后留下的少量肿瘤细胞方面(称为“微小残留病”,,或MRD,,minimal residual disease),,目前的技术需要通过大量测序才能找到。。。。因此,,,亟需开发新的方法,,,,提高检测灵敏度,,降低检测成本。。


近日,,美国麻省理工学院和哈佛大学的研究团队在《Nature Biomedical Engineering》杂志上发表题为“Massively parallel enrichment of low-frequency alleles enables duplex sequencing at low depth”的文章,,,,开发了一种名为“通过识别寡核苷酸富集次要等位基因测序”的新方法MAESTRO(minor allele enriched sequencing through recognition oligonucleotides),,,能以较小的测序规模,,,准确、、、高效地从患者血液样本中识别出数千个DNA突变,,,,有望以更低的成本协助检测患者体内的残存癌细胞,,,及时开展疾病复发监测。。。。


该研究中,,研究人员首先对患者的肿瘤活检进行测序,,了解突变的情况。。。。根据突变信息,,,针对性的开发出仅与肿瘤相关的DNA序列结合的分子探针,,用以富集血液样本中游离的肿瘤相关DNA,,,优化测序样本,,提升从血液样本中识别出罕见癌症突变的能力。。。


在检测数百个低丰度突变的测试中,,,,与传统测序方法相比,,,,MAESTRO方法在保证能发现大多数突变的同时,,,,所需的资源更少。。。同时,,,MAESTRO方法还以较低的成本将搜索范围扩大到1万个突变,,极大地提高了检测效率。。。。研究团队利用MAESTRO方法,,,重新检测分析一批传统方法检测过的患者样本,,,从中检出了更多的突变。。。。MAESTRO方法在单一检测方案中结合了深度和广度的优势,,,使更早检测MRD成为可能,,,,甚至可能识别出血液中来自癌细胞的循环DNA。。。


论文链接:

https://www.nature.com/articles/s41551-022-00855-9


注:此研究成果摘自《Nature Biomedical Engineering》杂志,,,,文章内容并不代表本网站的观点和立场,,,,仅供参考。。。


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